Information sur le laboratoire

Luke Harrison (M.D./Ph.D.)

Chercheur associé
Centre de biologie translationnelle
Département de microbiologie et d'immunologie (McGill)

Profil de recherche

 Fondamentale: 90%
 Clinique: 10%
 Épidémiologique: 0%
 Évaluative: 0%
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Mots-clés

Maladies infectieuses • mycobactéries • génomique comparative • métagénomique • biologie computationnelle

Intérêts de recherche

Mon programme de recherche étudie l'évolution et la pathobiologie des mycobactéries. Les mycobactéries habitent une variété d'habitats, notamment le sol, l'eau, la poussière et d'autres niches, et comprennent à la fois des agents pathogènes humains opportunistes et obligatoires comme Mycobacterium tuberculosis, l'agent de la tuberculose. Mon laboratoire intègre la génomique comparative et la métagénomique pour étudier Mycobacterium tuberculosis et les infections à mycobactéries non tuberculeuses. Mes projets actuels se concentrent sur l'élucidation de la dynamique génomique des infections à mycobactéries non tuberculeuses par le séquençage métagénomique direct d'échantillons d'expectorations. Un autre projet consiste à développer des outils computationnels pour l'analyse génomique comparative au sein du complexe M. tuberculosis. Mon objectif principal est de relier l'évolution microbienne aux résultats cliniques afin d'améliorer le diagnostic et la compréhension des maladies à mycobactéries.


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Dernières publications

  1. Danchuk, S. N., Duffy, S. C., Sullivan, J., Beenish Rufai, S., McIntosh, F. A., Lupien, A., Harrison, L. B., Ghasemi Goojani, H., Taylor, L., Wei, Y., Joubert, P., Mortensen, R., Chen, J. M., Niroula, N., Stevens, R., Norleen, C., Kapur, V. & Behr, M. A. (2025). Virulence hierarchies within the Mycobacterium tuberculosis complex. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 122, p. e2507104122.
  2. Lieu, A., Harrison, L. B., Harel, J., Lawandi, A., Cheng, M. P. & Domingo, M.--. C. (2024). The microbiological outcomes of culture-negative blood specimens using 16S rRNA broad-range PCR sequencing: a retrospective study in a Canadian province from 2018 to 2022. Journal of clinical microbiology, vol. 62, p. e0151823.
  3. Harrison, L. B., Kapur, V. & Behr, M. A. (2024). An imputed ancestral reference genome for the Mycobacterium tuberculosis complex better captures structural genomic diversity for reference-based alignment workflows. Microbial genomics, vol. 10.
  4. Harrison, L. B. & Behr, M. A. (2023). Mutation rates and the molecular epidemiology of Mycobacterium abscessus. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 120, p. e2307499120.
  5. Harrison, L. B., Bergeron, G., Cadieux, G., Charest, H., Fafard, J., Levade, I., Blais, A. C., Huchet, E., Trottier, B., Vlad, D., Szabo, J., Thomas, R., Poulin, S., Greenaway, C., Zaharatos, G. J., Oughton, M., Chakravarti, A., Pilarski, R., Bui-Nguyen, A., Benomar, K., Libman, M. D., Vinh, D. C., Duggan, A. T., Graham, M., Klein, M. B. & Barkati, S. (2023). Monkeypox in Montréal: Epidemiology, Phylogenomics, and Public Health Response to a Large North American Outbreak. Annals of internal medicine, vol. 176, p. 67-76.
  6. Barkati, S. & Harrison, L. B. (2022). Monkeypox outbreak 2022: "See one, do one, teach one" no longer the rule. Journal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada = Journal officiel de l'Association pour la microbiologie medicale et l'infectiologie Canada, vol. 7, p. 157-158.
  7. Darwish, I., Harrison, L. B., Passos-Castilho, A. M., Labbé, A.-C., Barkati, S., Luong, M.-L., Kong, L. Y., Tutt-Guérette, M.-A., Kierans, J., Rousseau, C., Benedetti, A., Azoulay, L. & Greenaway, C. (2022). In-hospital outcomes of SARS-CoV-2-infected health care workers in the COVID-19 pandemic first wave, Quebec, Canada. PloS one, vol. 17, p. e0272953.
  8. Thornhill, J. P., Barkati, S., Walmsley, S., Rockstroh, J., Antinori, A., Harrison, L. B., Palich, R., Nori, A., Reeves, I., Habibi, M. S., Apea, V., Boesecke, C., Vandekerckhove, L., Yakubovsky, M., Sendagorta, E., Blanco, J. L., Florence, E., Moschese, D., Maltez, F. M., Goorhuis, A., Pourcher, V., Migaud, P., Noe, S., Pintado, C., Maggi, F., Hansen, A.-E., Hoffmann, C., Lezama, J. I., Mussini, C., Cattelan, A., Makofane, K., Tan, D., Nozza, S., Nemeth, J., Klein, M. B., Orkin, C. M. & SHARE-net Clinical Group (2022). Monkeypox Virus Infection in Humans across 16 Countries - April-June 2022. The New England journal of medicine, vol. 387, p. 679-691.
  9. Ali, K., Azher, T., Baqi, M., Binnie, A., Borgia, S., Carrier, F. M., Cavayas, Y. A., Chagnon, N., Cheng, M. P., Conly, J., Costiniuk, C., Daley, P., Daneman, N., Douglas, J., Downey, C., Duan, E., Duceppe, E., Durand, M., English, S., Farjou, G., Fera, E., Fontela, P., Fowler, R., Fralick, M., Geagea, A., Grant, J., Harrison, L. B., Havey, T., Hoang, H., Kelly, L. E., Keynan, Y., Khwaja, K., Klein, G., Klein, M., Kolan, C., Kronfli, N., Lamontagne, F., Lau, R., Fralick, M., Lee, T. C., Lee, N., Lim, R., Longo, S., Lostun, A., MacIntyre, E., Malhamé, I., Mangof, K., McGuinty, M., Mergler, S., Munan, M. P., Murthy, S., O'Neil, C., Ovakim, D., Papenburg, J., Parhar, K., Parvathy, S. N., Patel, C., Perez-Patrigeon, S., Pinto, R., Rajakumaran, S., Rishu, A., Roba-Oshin, M., Rushton, M., Saleem, M., Salvadori, M., Scherr, K., Schwartz, K., Semret, M., Silverman, M., Singh, A., Sligl, W., Smith, S., Somayaji, R., Tan, D. H. S., Tobin, S., Todd, M., Tran, T.-V., Tremblay, A., Tsang, J., Turgeon, A., Vakil, E., Weatherald, J., Yansouni, C., Zarychanski, R., Canadian Treatments for COVID-19 (CATCO) & Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada (AMMI) Clinical Research Network and the Canadian Critical Care Trials Group (2022). Remdesivir for the treatment of patients in hospital with COVID-19 in Canada: a randomized controlled trial. CMAJ : Canadian Medical Association journal = journal de l'Association medicale canadienne, vol. 194, p. E242-E251.
  10. Yansouni, C. P., Papenburg, J., Cheng, M. P., Corsini, R., Caya, C., Vasquez Camargo, F., Harrison, L. B., Zaharatos, G., Büscher, P., Faye, B., Ndiaye, M., Matlashewski, G. & Ndao, M. (2022). Specificity of SARS-CoV-2 Antibody Detection Assays against S and N Proteins among Pre-COVID-19 Sera from Patients with Protozoan and Helminth Parasitic Infections. Journal of clinical microbiology, vol. 60, p. e0171721.
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